第16集:百官弹劾朱棣朱棣获罪入狱
朱允玟突然对吕氏说了一句，燕王行桀纣之事，反倒振振有词，这样的人如何帮太子治理天下。夫子眼角一跳，似是震惊，却什么都没有说。太子让朱棣带宫里的王太医回去给朱高炽治病，王太医诊治后称，朱高炽此病可痊愈，但以后不能骑马习武，体质也比常人要差一些。朱棣埋怨妙云急匆匆带病儿回京，造成了这样的局面。妙云反过来质问他，明明说回京师，为什么去的是凤阳。朱棣不想告诉她，妙云气在头上，让他去别的屋子就寝。
有很多不法官员被锦衣卫查处，朝堂上人人自危，昔日风光百官，锒铛入狱。缇骑所至，百官惶惶，太子进言，不能再让四弟胡来了。朱元璋却不以为意，知所戒惧，是为善也，心中有一怕，对这些百官没有坏处。胡惟庸面色沉重地看完一封信后，连夜去拜见老相国。老相国答应帮他，不过他也提醒胡惟庸，自身不正，何以正人，要想论人是非，自己得要是干干净净的才行。胡惟庸弯腰行礼，表示谨记，也不知他是否将这话听了进去。
户部员外郎黄景击鼓鸣冤后，自杀于承天门。百官于承天门叩阙鸣冤，而后全部跪在承天门前，燕王命锦衣卫，在门前杖责百官。许多人都是谈燕色变，太子痛心疾首，觉得父皇就不应该设这个锦衣卫，他现在都快不认识自己这个弟弟了。徐允恭想说服妙云劝谏朱棣，可妙云却表示自己要和燕王同进同退。胡惟庸上奏，让在锦衣卫中当值的诸位大臣家中之人，退出锦衣卫，即便不退，家中也容不下他们了。很快，有不少人被赶出家。
朱亮祖甚至捉拿了两个锦衣卫，残忍地杖毙两人，朱棣得知，命锦衣卫将永嘉侯府围了个水泄不通。锦衣卫正要动手，太子令到阻止。胡惟庸与永嘉侯等大臣，在奉天殿外跪倒一片，要求朱元璋裁撤锦衣卫。朱元璋忍着怒气让人问胡惟庸他们是不是要逼宫，此话十分严重。朱允玟和朱雄英打了起来，因为允玟说朱棣的坏话，而雄英历来和朱棣的感情要好，自然听不得。朱元璋问朱允玟为什么要说朱棣是酷吏，朱允玟不卑不亢地说，朝廷当与士林百姓共天下，而非与酷吏共天下。
他的话最终让朱元璋下诏，将朱棣拘禁待勘，铁铉也被捉拿议罪，锦衣卫暂归大都督府管。铁铉被施以酷刑，但他誓死不画押认罪，朱元璋竟然定了他一个绞监侯，赐全尸。他此举就是把朱棣的退路全都堵死了，胡惟庸摸不透朱元璋的心思。马皇后到朱元璋那儿大闹一场，也没能改变朱元璋的心意，朱棣被贬为庶人，收回燕王宝册及府邸，妙云携子归魏国公府别居。十二皇子等人，都去求朱元璋开恩。
太子希望老丈人能帮铁铉和燕王一把，但老丈人不肯，此时若帮，就是为自己树敌。燕王府内宫马和送妙云和高炽去魏国公府，看着年幼的儿子，妙云决定去帮朱棣。
